Untuk memenuhi tuntutan kebutuhan yang tinggi untuk kompetensi Teknik Industri , Program Studi Teknik Industri (PSTI) didirikan pada tanggal 27 April 1998 di Jurusan Teknik Mesin, Fakultas Teknik, Universitas Gadjah Mada. Program Sarjana Teknik Industri mulai beroperasi pada tahun ajaran 1998/1999. Dengan demikian, di tahun yang sama, dengan penambahan Program Studi Teknik Industri, nama jurusan akhirnya berubah dari Jurusan Teknik Mesin menjadi Jurusan Teknik Mesin dan Industri. Sejak tahun 2008, PSTI meluncurkan program magisternya, dan juga mendirikan program doktoralnya pada tahun 2016 sehingga PSTI saat ini terdiri dari program sarjana, master, dan doktor.
PSTI telah berkembang secara signifikan berkaitan dengan kemahasiswaan, staf pengajar, dan fasilitas. Penerimaan mahasiswa Program Sarjana cukup kompetitif, sebagai contoh pada tahun ajaran 2016/2017 perbandingannya adalah hanya satu dari 40 pendaftar yang dapat diterima. PSTI juga memperkuat posisinya sebagai program sarjana terkemuka di Indonesia dengan merekrut staf yang kompeten.
Kurikulum PSTI terbaru yang digunakan adalah Kurikulum tahun 2016 yang merupakan kurikulum berbasis outcome. Kurikulum dikembangkan dengan mempertimbangkan masukan dari semua unsur seperti dewan penasihat, mahasiswa, dosen, alumni, dan pengguna. Kurikulum PSTI tahun 2016 mengadopsi body of knowledge Industrial Engineering yang diformulasikan oleh Institute of Industrial and Systems Engineering (IISE).
Struktur kurikulum ditinjau secara berkala setiap lima tahun untuk mengevaluasi apakah kurikulum telah memfasilitasi kompetensi yang dibutuhkan untuk memenuhi kebutuhan masyarakat dan untuk menghadapi kemajuan pengetahuan dan teknologi yang pesat khususnya di bidang Teknik Industri. Silabus mata kuliah, efektifitas metode belajar dan mengajar, dan pencapaian hasil siswa ditinjau setiap tahun.
Program Teknik Industri secara teratur dinilai oleh badan penjaminan kualitas internal dan eksternal. Penilaian internal dilakukan setiap tahun oleh Kantor Jaminan Mutu (KJM), yang merupakan unit penjamin kualitas yang dikelola oleh universitas. Penilaian eksternal dilakukan oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN PT) setiap lima tahun. Akreditasi BAN PT terakhir pada tahun 2013 dan Program Sarjana Teknik Industri telah memperoleh predikat A (level tertinggi). Selain itu, Program Sarjana Teknik Industri juga telah disertifikasi oleh ASEAN University Network – Quality Assurance (AUN-QA) pada tahun 2015 dan mencapai skor 5,5 dari 7,00.